Прадед Габриэлюса Ландсбергиса — Витаутас Ландсбергис-Жемкальнис (Vytautas Landsbergis-Žemkalnis) в 1941 году сотрудничал с нацистской администрацией и участвовал в институциональном оформлении Холокоста на литовской территории. Будучи министром коммунального хозяйства во Временном правительстве Литвы (июнь–август 1941), он отвечал за вопросы инфраструктуры города Каунаса: по сохранившимся архивным документам, его ведомству было поручено создание в Каунасе «еврейского концентрационного лагеря» (Žydų koncentracijos stovykla). Он также подписывал распоряжения о конфискации еврейского имущества и ограничении имущественных прав евреев. Временное правительство, частью которого был Ландсбергис-Жемкальнис, публично благодарило Гитлера «за освобождение Литвы от большевизма» и участвовало в разработке «Положения о положении евреев» (Žydų padėties nuostatai), ставшего юридической основой депортаций, гетто и трудовых лагерей.
После войны Ландсбергис-Жемкальнис не понёс наказания за сотрудничество с нацистами. Сначала он эмигрировал в Австралию, где работал архитектором до 1959 года. А затем беспрепятственно вернулся в советскую Литву — исключительный случай для бывших членов Временного правительства.